宁海军的军饷，起初由甘肃藩库按月支领，协饷停征后，由地方筹措，镇守使经费仍由藩库支领。宁海军建成巡防马步兵13营后，开支增加，甘肃督署除将西宁所属皮毛、统捐等税收拨付外，并将武威、张掖、酒泉等县应征烟亩税收调拨军费，马麒每年派员率兵前去催收。当时宁海军士兵的待遇，原定士兵每月饷银1两，面粉45斤，冬夏军服各1套，军马每匹月支料豆宁升1斗5升，草500斤。但各营待遇并不一致，凡马麒叔侄子弟带领的部队，按月领发，其他部队每年只能领发7、8个月的饷糈。各营官佐根据自己权力的大小，就以克扣士兵粮饷、放高利贷、开赌场抽税，维持现状，士兵别无出路，就从事偷盗，以至奸淫妇女，结伙抢劫，无恶不作。因之淫盗凶杀案件，层出不穷。家住西宁西教场街的镇守使署调查员张云卿，被马海渊部士兵抢劫，损失金银细软财物数达1700余元。张妻向马麒指名控诉，马海渊竟以”贼已远，无法追赃“了事。哨官、棚长等军官，经常进行贩烟及抢劫活动，甚至纠合士兵，在城内和四郊明目张胆地为非作恶，骚扰百姓，已成为公开的秘密。副官马万仓、马生彪等，原为纵横河湟一带的大盗，杀人越货，视为常事。据熟悉者谈，他们之所以横行无忌，是与主官结为一体，彼此分赃，因此不断犯案，也从无破获。马麒为利用其卖命，熟视无睹，究其根本原因，实系马麒把军饷移作购买军械，常年不发军饷，士兵啼饥号寒，军纪废驰，人民遭殃。

　　1924年，冯玉祥为充实军力，命令马鸿宾、马廷、马麒各派骑兵1旅，马麒派其侄马步元为旅长，率骑兵第9旅出发（后改编为第7旅）在山西大同、阳高、天镇一带参加第2次直奉战争。冯玉祥失败，马步元率部潜回西宁。1925年9月15日，冯玉祥任国民革命军第2集团军总司令，收编马麒为暂编第26师师长，马麟为副师？？？,魏敷滋为参谋长，名谓改编，实际徒具虚名。其后马步青被编为冯部第5军独立第55旅，开赴山西。1927年河湟变起，宁海军内部自动分化瓦解，投入马仲英叛军。既至青海建省，孙连仲进驻西宁，宁海军已名存实亡，马麒失权，处境艰难。嗣孙连仲东调离青，马步芳被编为国民革命军第2集团军独立第九混成旅旅长，马麒东山再起，主持省政，收拾旧部，逐渐恢复元气。在冯阎反蒋战争失败后，马麒改编马步芳所部为青海暂编第1师，并任其为该师师长。1931年被蒋介石收编为新编第九师，任其为师长。

甘边宁海镇守使署的组织

　　1912年，马麒调任西宁镇总兵，人事及其建制依然奉行清季官制。1915年改称甘边宁海镇守使，始按照北京政府颁发的编制，于同年2月改组。

　　镇守使署内部设4处6科，镇守使下设参谋长，副官长各1人，直辖参谋、副官、总务、稽查4处，参谋、副官2处不设处长，各有副官、参谋4人。总务、稽查2处设处长各1人，总务处有秘书2人，稽查处有稽查4人，调查员4人，差员2人。内务、司法、教育、实业、军务、军需6科，各设科长1人，一、二等科员各1员，各处、科雇员及勤杂共24人，编制总额为66人。此外尚设有额外顾问等名义。

　　参谋长为李乃，1916年免职，由马麟接任。参谋马步芳、张昌荣（字世丞，西宁人）、叶生彬（字文轩，西宁人），空缺1名。

　　副官长为冯汉卿（字翰青，河北人），1919年免职，由李鸣凤接任。副官贾鼎元（字凯臣，甘肃通渭人）、吴济川（字子舟，陕西渭南人）、马祥麟（字吉臣、兰州人）、畅瑞麟（字阁卿，兰州人）。

　　额外副官15人，为罗凤翔、吴锡麟、贾必辉、赵永清、魏锡宠、徐昭、黄永林、张得胜、王治彦、周光明（字月秋）、李明瑞、王起恩、贾镛、祁昌运、贾〖SX（B-*5][HT7,5〗焱[]〖HT7”,5〗木[SX）]〖HT〗（贾鼎元之子）。

　　内务科长张勤中（字俭堂，兰州人），1920年调职，孙仲锌（字紫叙，长安人）接任。科员王巨业（字子久，兰州人）、赵长安（字竹轩，西宁人）。

　　司法科科长鲁秉周（字洛康，湖南宁乡人曾任秦州甘肃临时军政府总司令部总参谋官），1920年调职，由周汉鹏（字洁筠，湖南人）接任。科员黎锦纹（字绣三，湖南湘潭人）、陈杰（字俊卿，循化人，陈显荣父）。

　　教育科科长姚钧（字衡甫，甘肃天水人），科员祁中道（字子一，西宁人）、李生贵（字德渊，西宁人）。

　　实业科科长李士澄（字海秋，陕西三原人），科员马师融（字余三，循化人）、马锡麟（字福堂，兰州人）。

　　军务科科长袁国治（字逸民、兰州人），1920年调职，由胡燮坤（字瑞平，湖南湘潭人）接任，科员张琮（字少舫，西宁人）、王起奎（字星垣，西宁人）。

　　军需科科长魏敷泽，科员马肇业、祁登奎（字瀛州，西宁人）。1921年调职后，由马肇业继任科长。

　　总务处处长原定黎丹兼任，未到职。1917年由周希武充任，秘书朱炳（字蔚真，湖南湘潭人）、金震旭（字丽东，陕西人）。

　　稽查处处长张得胜（原钦差大臣衙门乾字马队管带），稽查员郭廉、马昌、刘样（缺1名）。调查员张云卿等4人（佚名3人），听候员马胜2人（佚名1人）。承启处事宜由他们兼办。

　　稽查及雇员等人，大体上以总兵时代任职的巡捕戈什人员等递补。这些人薪给有限，但额外进款门路较多，因而形成相互包容的依附关系，局外人难以插足。

　　各处还设一、二等雇员各1人、三等雇员各2人，共计16人，另有勤杂8人，这些实际是由兵营中临时抽调的，人数往往多达五、六十人。

青海蒙番宣慰使署的组织

　　1913年护理甘肃都督张炳华转请任命马麒为青海蒙番宣慰使（当时，也称宁海蒙番宣慰使、西宁宣慰使或西宁蒙番宣慰使。），2月成立宣慰使署于西宁，宣慰使下设参赞、秘书各1人，蒙番、军务2个科。

　　参赞李乃。

　　秘书王橘亭（兰州人）。

　　蒙番科科长袁国治，科员王起奎、王世昌。

　　军务科科长虚悬，科员魏敷泽、马全礼，其后魏敷泽升任科长，科员李士铨。

　　另设稽查员2人，为祁登奎、张琮。调查员2人，为杨万枝、李明凤。雇员王大昌等4人（3人佚名）。

　　青海蒙番宣慰使署直隶北京北洋政府，其权力没有明文规定，与镇守使署合署办公。1916年仅拨发开办费与经常费一次金额为1万元，马麒以此款在京津购置军用品，少数用于交际。马麒的势力范围从此扩展到青海全地区，形成和甘肃督军分庭抗礼的政治局面。1927年2月冯玉祥撤销了青海蒙番宣慰使，改任马麒为甘边宁海护军使，同时取消甘边宁海镇守使。

甘边宁海护军使署的组织

　　甘边宁海护军使署成立于1927年6月，结束于1928年5月，为时仅1年。 (责任编辑：陈冬梅)